1.平板计数法
通常使用的培养基为紫红胆盐乳糖琼脂。准备两套平板，每个平板各加入稀释范围内的样品液1ml，另加15ml熔化并冷却至45℃的紫红胆盐乳糖琼脂充分混匀。再覆盖5ml琼脂培养基，凝固后将平板翻转，置于35℃培养24h,进行大肠菌群计数。培养后的大肠菌群为深红色菌落。通常典塑大肠菌群的菌落直径为0.5mm或稍大，紧贴菌落周围有胆盐沉淀。当几个菌落长在一起时菌落可能变小。如果食品中含有碳水化合物而不含乳糖，那么当低稀释度（既高浓度）食品加到培养基中可能导致前文提及的异常结果。对10-2或更低稀释度的平板，有必要对大肠菌群的假阳性结果进行验证，可将菌落挑选出来,转接到乳糖肉汤或麦康凯肉汤中在35℃培养后验证，或用Eijk-man试验验证大肠杆菌的存在。
2.干燥复水膜计数法
干燥复水膜是一种十分有用的大肠杆菌计数膜。用紫红胆盐培养基作为基础培养基，添加5-溴-4-氯-吲哚-β-葡萄糖苷酸以检测葡萄糖醛酸的活性。大肠杆菌在平板上为蓝色菌落并伴有气泡产生。该产品便于操作和读数，巳被作为AOAC确认为官方方法。
3.滤膜法
将滤膜（MF)和改进的选择性培养基结合使用，可检测某些样品中的大肠菌群和大肠杆菌。该方法对饮用水的检测十分有用。
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