工作菌株由冻干或超低温保存的标准储备菌株制备。转接操作时要注意避免标准菌株可能发生的交叉污染和菌株的退化。制备工作菌株时，应将参考原株转接到多份非选择培养基中培养，得到稳定期的菌株。
对于商品化的保藏菌株必须严格按照厂商的说明执行。
注：工作菌株不能再传代。但工作菌株如果处理或储存得当[即不存在交叉污染和(或)在一周内不退化]，则可以多次使用。
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