这种检测方法可以帮助内科医生选择合适的治疗方法，因为它可以预测药物在某个患者身上是否有效。药物抗性是HIV治疗不成功最常见的原因之一。
此外，这种检测方法还可以反映出HIV病毒内发生的遗传变异或突变，这将有助于科学家理解病毒如何进化而衍生出抗药性的分子机制。这些知识的累积将有助于研发出一套新的疗法，避免病毒产生抗药性。
HIV基因极易突变，而且病毒的增殖速度很快，感染HIV的病人身上往往有着不同类型的HIV病毒。在一些病例中，突变的病毒株产生了抗药性，使抗逆转录病毒疗法不再有效。
研究人员分析了来自三个不同治疗背景的HIV病人的血样，并从中分离得到遗传物质，并将一些荧光标签加入到遗传物质中。与突变基因可以专一地结合的标签会发绿色荧光，没有突变的区域则呈现出红色荧光。
研究人员再利用高敏感度的计算机，从一万个没有突变的病毒群中找出一个发生突变的病毒。除了可以检测一个突变位置外，它还可以检测两个以上的点突变，现今的检测方法都做不到这一点。因为有些病人在接受治疗时同时服用多种药物，所以容易产生多位点突变的HIV病毒株。这种检测法也可以应用于其它类型的病毒感染，例如肝炎病毒、肺结核病毒等。
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