衣原体是一种既不同于细菌也不同于病毒的一种微生物。其与细菌的主要区别是其缺乏合成生物能量来源的ATP酶，也就是说衣原体自己不能合成生物能量物质ATP，其能量完全依赖被感染的宿主细胞提供。而衣原体与病毒的主要区别在于其具有DNA、RNA、两种核酸、核糖体和一个近似细胞壁的膜，并以二分裂方式进行增殖，能被抗生素抑制。 衣原体属于原核类生物。
衣原体有两种存在形态，分别称为原体和始体。原体有感染力，它是一种不能运动的球状细胞。原体逐渐伸长，形成无感染力的个体，称为始体，这是一种薄壁的球状细胞，形体较大。
侵染粒子呈直径0.3微米的球形，可用光学显微镜看到；在被细胞壁和细胞膜包裹的细胞质中有核糖体；核酸同时含有DNA和RNA；已证明有葡萄糖代谢活性和蛋白质合成能力；在细胞液胞内增殖，不进入细胞质质内。侵染粒子通过吞噬作用进入细胞波胞内，转化成一般称为网状结构体的粒子。网状结构体通过分裂增殖，在浸染后期成熟为侵染粒子。因此，在增殖周期中，虽没有保持作为粒子的连续性的潜伏期，然而，由于没有证实网状结构体的侵染性，所以从外表看起来，有一个相当于潜伏期的时期。
1957年开始将衣原体分类于细菌类。衣原体广泛寄生于人、哺乳动物及禽类，仅少数致病。据抗原构造、包涵体的性质、对磺胺敏感性等的不同，将衣原体属分为沙眼衣原体、鹦鹉热衣原体肺炎衣原体三个种。其中沙眼衣原体又有三个生物变种，即沙眼生物变种、性病淋巴肉芽肿（LGV）生物变种和鼠生物变种。沙眼生物变种还有A～K14个血清型（包括Ba、Da、Ia）。LGV生物变种还有4个血清型，即L1、L2、L2a和L3。
衣原体（chlamyida）是一类能通过细菌滤器，严格细胞内寄生，有独特发育周期的原核细胞性微生物。衣原体广泛寄生于人类、鸟类及哺乳动物。能引起人类疾病的有沙眼衣原体、肺炎衣原体、鹦鹉热肺炎衣原体。其共同特征：1 体积大于病毒，约250~500nm，在光学显微镜下可以查见。2 含有DNA和RNA。3 具有细胞壁，但无肽聚糖，只含微量的细胞壁，由二硫键连接的多肽作为支架。4 对多种抗生素敏感。5 具有一些酶类但不够完善，这些酶缺乏产生代谢能量的作用，要由主细胞提供。能在鸡胚卵黄囊及多种细胞中生长繁殖。6 有独特发育周期，仅在活细胞内以二分裂方式繁殖。
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