正常菌群：生活在健康动物各部位，数量大、种类较稳定且一般是有益无害的微生物。正常菌群是一个相对的概念，当机体防御能力降低时（如皮肤大面积烧伤），一部分正常菌群会变成病原微生物。
人体正常菌群的存在部位：人体皮肤、黏膜、与外界相通的腔道如：口腔、鼻咽腔、消化道、泌尿生殖道。
在机体的不同部位，正常菌群的微生物种类不同，当正常菌群的存在部位改变时，一部分正常菌群会变成病原微生物，如存在于消化道的E.coli进入泌尿生殖系统时可引起肾盂肾炎或膀胱炎。
无菌动物与悉生动物：凡在体内外检查不到任何正常菌群的动物称为无菌动物；凡已人为地接种上已知纯种微生物的无菌动物或无菌植物，称为悉生生物。
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