自然界中各种微生物混杂地生活在一起，要研究某种微生物的特性，其先决条件必须使该微生物处于纯培养状态，也就是说，培养的是微生物的某一个种或株，培养中的所有细胞有着共同的来源和仅是同一细胞的后代。使用显微操作器（micromanipulator）单细胞挑取法，可以直接得到纯培养，但一般都用稀释涂布平板法或稀释混合平板法或划线平板法来分离、纯化微生物以获得纯培养，因后几种方法不需要特殊的仪器设备，一般情况下都可顺利地进行，效果也好。
不同的微生物培养在固体、液体或半固体培养基中，微生物自身的群体形态和它的生长繁殖情况都不一样，表现出一定的培养特征和生长规律，了解它们的培养特征和生长繁殖规律，对识别和控制利用微生物具有重要价值。
厌氧微生物的培养有其特殊性，主要是采取各种方法使它们处于除去了氧的环境或氧化还原电位低的条件下进行培养。随着对厌氧微生物培养方法的改进，发现它们在自然环境中的存在，无论是种类还是数量都大大超过以往的估计，它们的作用也显得很重要。
纯培养所得到的菌种，每个菌种都具有自己的特性，例如形态、生理、生化、血清学和遗传特性等，因此，无论研究工作或生产只有每次使用同一菌种，才能得到同样的结果，这样就需要将菌种（纯培养物）保藏起来，以备每次使用，这也说明菌种保藏工作是整个微生物学工作的基础，是一项很重要的工作。
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