在进行培养基的配制时，标准或说明书上通常描述为使用蒸馏水或纯化水配制，对此有不少人有疑问，那么这些水有什么不同的？配制培养基是否可以通用呢？
在《GB/T 6682-2008 分析实验室用水规格和试验方法》标准中，将实验室用水分为了一级水、二级水、三级水三个等级。
一级水：可以用二级水经过适应设备蒸馏或离子交换混合床处理后，再经过0.2μm微孔滤膜过滤来制取，25℃电导率≤0.01mS/m，用于有严格要求的分析试验（如高效液相色谱）。
二级水：可以通过多次蒸馏或离子交换等方法制取，25℃电导率≤0.1mS/m，常用于无机痕量分析等试验（如原子吸收光谱分析用水）。
三级水：可用蒸馏或离子交换等方法制取，pH5.0-7.5（一级水和二级水纯度很高，pH不做要求），25℃电导率≤0.5 mS/m，用于一般化学分析试验。
在《GB4789.28-2024 食品安全国家标准 食品微生物学检验 培养基和试剂的质量要求》标准中，制备培养基用水要求的25℃电导率不超过25μS/cm（即＜2.5mS/m），除此之外，对微生物数量也是有要求的，微生物污染数量不超过103CFU/mL。可以看出，实验室一级、二级、三级水电导率都是符合标准中培养基用水的要求，只要微生物污染数量不超标，配制一般的微生物培养基完全没有问题的（水的纯度越高越好，但考虑成本和获取难度，通常用三级水是足够的）。
注：进行维生素测定培养基的制备时，要求使用二级水以上的标准，且要注意不能受到容器和环境的污染。维生素测定培养基对水质要求高于一般的培养基，水中不能有维生素的残留。进行细胞培养使用的培养基的要求也是高于一般的微生物培养基用水，特别是内毒素不能超标。
蒸馏水/双蒸水/三蒸水等：通过蒸馏的方法获得，蒸馏次数越多通常代表水的纯度越高，实验室通常使用蒸馏水即可满足一般微生物培养基的配制要求。
纯化水：一般出现在药典标准中的描述，通常使用离子交换方法制取，25℃时电导率要求不超过5.1μS/cm（即＜0.51mS/m），纯度要求高于实验室三级水和GB4789.28标准中的质量要求，代替蒸馏水配制培养基是没有问题的。
注：药典标准要求更高一些，因此在进行药品的检验配制培养基时，通常需要按照药典标准的纯化水要求执行，虽然使用GB4789.28标准中的水制备并不会影响检验结果，但这个结果可能不会被认可。
去离子水：通常利用离子交换树脂除去水中的阳离子和阴离子，电阻率通常＜2μS/cm（即＜0.2mS/m），代替蒸馏水配制培养基也是没有问题的，但需要注意去离子水中可能会有有机物残留，确保微生物污染不会超标。
综合以上所述，进行一般的微生物培养基配制时，只要水质的电导率和微生物限度合格，使用蒸馏水、纯化水或去离子水配制培养基都是可以的。若使用的水质不佳，可能会导致一些培养基灭菌后呈现比较浑浊的状态，特别是一些含磷酸盐成分较多的培养基（如磷酸盐缓冲液），灭菌后可能呈现浑浊或者有沉淀的样子。另外容器也可能是污染水质的原因之一，刷洗后的玻璃容器一定要使用蒸馏水充分冲洗干净，减少残留。不可使用自来水、矿泉水配制培养基（含离子较多）。紧急或特殊情况下，可以采购娃哈哈纯净水（注意是纯净水，不要买成矿泉水或者白开水之类的）配制培养基，这个水经过实测非常好用，即使是配制维生素测定培养基也没问题的。
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