和其他方法相比，微生物发酵生产香料香精产品具有无比的优越性。这主要表现在以下6个方面：
1、工业化生产，免受自然环境的不利影响
微生物发酵生产香料香精是在工厂内进行，可以免受土壤、气候、温度和季节等自然环境条件的不利影响，因而能够大规模地常年进行工业化生产。
2、常温常压，生产过程容易控制
微生物发酵生产香料香精，不需要高温、高压和催化剂，在常温常压的条件下进行，因而生产条件容易得到保证，生产过程容易得到控制，有利于产品质量的稳定和提高。
3、生产周期短，产量收获高
微生物的特点之一就是繁殖快，代谢旺。微生物每完成一代的繁殖时间只需十几分钟至几个小时。如果条件许可，在一天时间内，微生物通过繁殖可以获得数量极其庞大的菌体群体。每个菌体又是一个小小的发酵工厂，旺盛的代谢有利于产物的形成。
这样就可以在很短的时间内，完成一批发酵产品的生产。因此和传统的香料植物的生长过程和香精的调配相比，在相同的时间内微生物法可以获得更多的产量。
4、变废为宝，减少环境污染
微生物食谱很杂，对营养要求一般不高，很多废物可以用来培养微生物，许多农副产品，如秸秆、麸皮、饼粉、杂草和畜肥等，工厂三废如酒糟等都可用作培养微生物的原料，因而原料来源十分广泛。这样不仅为这些废弃物找到出路，变废为宝，综合利用，而且减少这些废弃物对环境的污染。
5、成本低，效益高
微生物发酵生产香料香精，不需昂贵设备，原材料来源广泛，又节约大量耕地，能源消耗低，人员管理也非常有限，因此成本很低。而生产周期短，产 品产量大，质量稳定，因而经济效益很高。
6、独辟新径，开发新产品
和动、植物相比，微生物具有众多的代谢类型，因而可以获得众多的代谢产物。这就是说，通过微生物发酵生产香料香精，既可以生产出传统方法生产出来的香料香精产品，还可开发出香料香精新产品，以满足消费者的需要，造福于全人类 。
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