经过30多年的发展，基因重组已成为一项最基本的基因操作技术，在生命科学研究中发挥了极其重要的作用。同时，基因工程技术自它诞生之日起，就以应用作为研究目标，以新型蛋白质类药物的研究开发为重点，政府、企业、大学和研究单位投入了大量的人力和物力用于基因工程的应用研究，而且在世界范围内展开了激烈的竞争。今天，基因工程的研究开发水平已经成了反映一个国家竞争力的重要指标，并将对世界经济的可持续发展、人们生活水平和生活质量的提高及解决人类所面临的许多重大问题产生深远的影响。
我国对基因工程的研究和开发也十分重视，自20世纪70年代末以来，一直将基因工程作为生物科学与技术领域研究、开发和产业化的重点，组织了大量的基础研究和科技攻关项目，促使我国在基因工程研究和应用领域迅速缩短了与世界先进水平的差距，在基础研究和产业化方面都取得了重要进展。
近年来，基因工程已成为生物科学与技术的核心技术，基因工程本身也有了重大的进展和外延。基因工程的宿主细胞已经从微生物发展到植物、动物和人类细胞；基因工程的目的基因已经从单个基因推广到基因簇，并从基因组学的高度解决目的基因的来源、定位和功能，形成了基因组工程的新学科;从人类基因组和植物、动物、微生物基因组研究获得的海量信息，开始发展后基因组工程，以便开发利用基因组学的巨大研究成果。生物芯片技术、体细胞克隆技术、基因诊断和基因治疗技术等都已经崭露头角。这些研究工作的顺利开展，将极大地推动人类对生命现象和生命规律的认识，促进人类文明的发展，并为生物技术发展成为21世纪的支柱产业作出重要贡献。
代谢工程的发展使基因重组技术的应用扩大到了非蛋白质类产物的生产、有机污染物降解等新的领域，已经在发酵法生产氨基酸、核苷酸、抗生素等微生物高产菌株选育中发挥了重要作用。
总之，基因工程已经成为工业微生物学的重要手段，将为提高微生物发酵产物产量、开发新的发酵产物作出重要贡献。
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