许多反应中正磷酸既不是底物，也不是反应产物，但是催化该反应的酶仍有可能受到磷酸盐的阻遏。与放线菌生产抗生素的代谢途径中，有关的这类酶有：脱水四环素（ATC）氧化酶、p-氨基苯甲酸（PABA）合成酶和泰乐霉素发酵中的某些合成酶。
在S.aureofaciens中，ATC合成酶催化四环素合成途径中最后第二个反应，这种酶在细胞内的比活对培养基中的磷酸盐非常敏感，但经过提纯的酶活却不受磷酸盐的影响，说明是细胞内这种酶的合成受到了磷酸盐的阻遏而不是简单的抑制作用。与杀假丝菌素合成有关的PABA合成酶也受到磷酸盐的强烈阻遏，虽然磷酸盐的存在会激发RNA合成，但与PABA合成酶有关的基因pabS却受到了抑制。事实上已经鉴别出了pabS结构基因的启动子，该启动子受磷酸盐调节。在S.fradiae发酵生产泰乐霉素的生物合成途径中，已经发现至少有三种酶受到磷酸盐的阻遏，值得一提的是催化泰乐霉素合成最后一步反应的大菌素（Macrocin）O-甲基转移酶，该酶由基因tylF编码，也受到磷酸盐的阻遏。
在霉菌生产β-内酰胺类抗生素的合成途径中也有一些酶受到磷酸盐的阻遏，如头孢菌素C合成途径中的几种酶，包括ACV合成酶、环化酶及扩展酶等都受到磷酸盐的阻遏，而且磷酸盐还起到了部分抑制酶活性的作用。
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