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磷酸转移酶参与氨基糖苷的形成。在抗生素的生物合成途径中，首先合成的是磷酸化的无活性中间产物，然后经过酶催化脱去磷酸基团而生成最终的活性产物。
在S.glancescens和S.griseus中，编码链霉素-6-磷酸磷酸转移酶的基因与其他生物合成基因相连接，而且受到磷酸盐的阻遏。在Sgriseus培养时，过量的磷酸盐会造成链霉素-6-磷酸的积累，而在正常情况下，特殊的磷酸转移酶应该将链霉素-6-磷酸转化为有活性的抗生素。在S.fradiae培养时，新霉素生物合成的磷酸化中间产物转化为最终活性产物的过程也受到磷酸盐的抑制和阻遏。各种氨基糖苷类抗生素生物合成途径中都存在类似的磷酸化-脱磷酸反应。除氨基糖苷类外，其他抗生素合成中也可能存在这类反应，虽然磷酸盐所阻遏的究竟是什么酶还不是很清楚，但磷酸盐的阻遏作用是抗生素生产中普遍存在的现象。
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