抗生素生物合成的反馈调节已经从两个方面得到证明。直接的实验事实是：如果在培养基中加入产物，抗生素的合成将会停止；间接证据是：若将产生的抗生素不断地从发酵液中分离，将增加抗生素的产量。但是这些实验却无法区分引起这种现象的原因究竟是酶合成的阻遏还是酶活力的抑制。只有对那些生物合成途径中的酶系已经了解得比较清楚的体系，才有可能进行深人的研究。
在Streptomyces venezuelae发酵生产氯霉素的发酵液中加入氯霉素或其p-甲硫基类似物会抑制抗生素生产。研究工作已经证实产物对芳胺合成酶有阻遏作用，该酶的作用是将分枝酸转化为p-氨基苯丙酮酸，这是氯霉素生物合成过程中第一个特殊的中间代谢产物。
在嘌呤霉素发酵中，生物合成途径最后一个酶是O-甲基转移酶，其活性受到终产物的抑制。在泰乐霉素和霉酚酸发酵中，同样存在着产物对O-甲基转移酶的抑制现象。
抗生素的生产也会受到初级代谢产物反馈抑制的间接调节。例如在 Penicillium chrysogenium发酵生产青霉素时，赖氨酸积累会抑制其本身合成途径中的第一个酶（单柠檬酸合成酶），该酶催化反应的产物是α-氨基己二酸，是青霉素合成的前体。因此赖氨酸的反馈抑制虽然存在于初级代谢途径，但对青霉素的生产也会有影响。另一个例子发生在用Stretomyces griseus发酵生产杀假丝菌素的过程中，由于芳香属氨基酸色氨酸在莽草酸途径中的反馈抑制作用，使通过该途径合成的杀假丝菌素前体p-氨基基苯甲酸的合成受到影响，从而也抑制了抗生素的生产。可以看到，通过对反馈抑制机理的研究对抗生素生产菌种的选育具有指导意义。
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