在对数生长期的培养容器中不断添加新鲜的培养基，同时不断放出代谢物，使微生物所需的营养及时得到补充，有害的代谢产物又能够及时排除，菌体的生长不受影响地始终处于对数生长期，这就是连续培养。要达到连续培养的目的，就要在分批培养的基础上，引有效的营养物补充和代谢物排出的控制装置。连续培养的控制方式主要有两类：恒化培养和恒浊培养。
优点：
与分批培养相比，连续培养最大的优越性是培养可连续运行，生产周期缩短，能提高设备利用率和生产效率。另外，它还便于自动化控制，产品的质量稳定。
局限性：
（1）连续培养是数百、数千小时长时间的连续操作，它较易受杂菌的污染即使初始染菌数量极少，也可能引起严重的后果。另外，连续发酵的设备较复杂，也容易导致染菌。而一旦染菌，造成的后果比批式培养会更严重。特别是连续培养中常见的多级(多罐)发酵，一个生产罐染菌，所有的罐都要停止运作，必须灭菌后再启动。
（2）连续培养的收率和产物浓度相对批式培养要低，这将不利于下游的提取操作。
（3）连续培养的营养物质利用率较低，会增加生产成本。
（4）连续培养必须与整个作业的其他工序连贯进行，它对设备的要求较高，需要复杂的检测和控制系统。
（5）连续培养更易受菌种退化的影响，因为退化菌往往比生产菌更具生长优势，少数退化菌经较长时间的培养，会逐渐占据优势，从而造成减产。
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